Ce cichlidé nain mesure autour de 6 cm à l'âge adulte contre 4 cm chez son cousin le ramirezi. Il est reconnaissable aux liserés roses à rouge vif de ses nageoires et à la bande noire caractéristique qui traverse l'œil. Les nageoires anale et pelvienne sont tachetées de bleu irisé. La morphologie globale rappelle les grandes espèces de Geophagus, avec une tête massive comparée à la taille du corps. Cette dernière est teintée de jaune tandis que le corps est de couleur vert olive.
Les mâles sont légèrement plus grands que les femelles mais le dimorphisme reste discret chez cette espèce. Le deuxième rayon de la nageoire dorsale est plus court chez les femelles. Comme chez les ramirezis, le ventre de la femelle est ponctué d'une tache rouge lors de la période de reproduction.
D'un tempérament discret, le ramirezi bolivien vit dans la végétation et à proximité des fonds vaseux. Il est rencontré à faible profondeur, en groupe de quelques individus éparpillés ou en couple pendant la saison de reproduction. Comme son cousin, il est géophage et trouve sa nourriture en fouillant les débris végétaux. C'est un poisson lent qui peut montrer des signes de territorialité, en particulier en période de reproduction.
Mâles et femelles forment des couples unis. La ponte survient après une parade, préférentiellement sur les galets ou une pierre plate qui peut être en partie recouverte de sable. Avant la ponte, le futur nid est consciencieusement préparé et nettoyé par les deux parents. Comme chez les ramirezis, le mâle et la femelle prennent soin de la ponte à tour de rôle. Ils protègent également les larves. En cas de gêne ou de danger, les parents n'hésitent pas à déplacer les larves vers une zone plus propice, un comportement
Omnivore, ce poisson fouille le substrat à la recherche de matières végétales et de petits organismes.
Le Mikrogeophagus altispinosus est endémique au bassin supérieur du Río Madeira, l'un des plus gros affluents de l'Amazone. Parfois appelé « ramirezi bolivien » ou « cichlidé de Bolivie », c'est l'une des espèces emblématique du Río Mamoré. Ce poisson est un proche cousin du ramirezi avec lequel il a souvent été confondu par le passé. Il est bien moins connu du monde aquariophile.