Pycnochromis vanderbilti mesure entre 4 et 6 cm. Ce poisson est tricolore avec un corps majoritairement jaune, bleu et noir. Il possède également des rayures horizontales de couleur bleu.
Pycnochromis vanderbilti est un poisson vivant en petit groupes qui réside naturellement à proximité du fond. C'est une espèce carnivore au tempérament calme. Cette espèce est territoriale et apprécie peu la présence d'intrus à proximité, en particulier les animaux au comportement similaire. Elle peut également se montrer virulente à l'encontre de congénères. Cependant, Pycnochromis vanderbilti ne se préoccupe guère des animaux non territoriaux.
Pycnochromis vanderbilti est un poisson ovipare qui pond sur substrat découvert. Ce poisson protège sa ponte contre les prédateurs alentours.
Pycnochromis vanderbilti est un poisson vivant en eau de mer.