Aphyocharax rathbuni mesure entre 4 et 5 cm. Vu sa petite taille, Il est couramment qualifié d'animal « nain ». Ce poisson est bicolore avec un corps majoritairement rouge et argent.
Les femelles possèdent un abdomen plus rebondi que celui des mâles, elles sont généralement plus trapues. Cette caractéristique est exacerbée en période de reproduction.
Aphyocharax rathbuni est un poisson vivant en banc qui réside naturellement à mi-profondeur et proche de la surface. C'est une espèce omnivore au tempérament plutôt vif. Mesurant à peine quelques centimètres, cette petite espèce a tendance à se montrer discrète et se cacher en présence de voisins plus imposants. De manière générale, cette espèce ne se préoccupe guère des autres animaux croisant sa route.
Aphyocharax rathbuni est un poisson ovipare qui pond en eau libre.
Aphyocharax rathbuni est un poisson vivant en eau douce originaire d'Amérique du Sud.