Synodus synodus possède un corps allongé d'environ 20 cm, bien que certains spécimens puissent atteindre 43 cm. Tête effilée et aplatie comme celle d'un lézard. La bouche est inclinée vers le haut et les yeux sont disposés sur la face supérieure de la tête, caractéristique des espèces qui s'enfouissent partiellement.