Le vairon possède des rayons durs (épines) sur les nageoires dorsale et anale. Les nageoires sont arrondies et transparentes, la dorsale se trouve sur le deuxième tiers du corps et assez haute. La caudale est très échancrée. De teinte globalement brun-vert, foncée sur le dos et claire sur le ventre, avec des taches sombres parfois reliées pour former des barres verticales le long du corps. Le corps est allongé, la tête arrondie, la mâchoire supérieure dépassant légèrement de l’inférieure.
En période de frai, comme tous les vairons, les mâles arborent une parure nuptiale éclatante et très colorée, associant noir, blanc, rouge, jaune citron voire vert vif.
Le vairon a une activité surtout principalement diurne. Il vit en banc de quelques dizaines d’individus ou plus, reste principalement près du fond et profite du couvert de la végétation en été ou des caches entre les rochers. Omnivore, il se nourrit d’algues et de débris végétaux, de petits mollusques et crustacés, de petits insectes ou de leurs larves, et occasionnellement d’œufs d’autres poisson. Il se tient souvent face au courant en attendant de voir passer la nourriture à sa portée, ou fouille près du fond pour débusquer ses proies. Il est une proie courante des poissons prédateurs, notamment les salmonidés, mais aussi les brochets et perches. Sa durée de vie est de 6 ans en moyenne.
La maturité sexuelle est atteinte à 2-3 ans. Le vairon se reproduit en été (juin-juillet), il remonte le cours d’eau jusqu’à des zones peu profondes à fond de gravier « propre » (pas de vase ou de végétation) et très oxygénée où se rassemblement des centaines d’individus. Le mâle revêt alors une livrée nuptiale, tirant sur le rouge. Les femelles pondent en plusieurs fois, jusqu’à 1000 œufs chacune, dépendant de leur tail
Se nourrit de petits organismes appelés infusoires et d'algues
Phoxinus phoxinus, ou vairon commun, est un poisson d'eau douce (zone tempérée) originaire d'Europe. Souvent utilisé pour l'alevinage des cours d'eau, il présente un risque d'ingression envers les espèces endémiques comme le vairon du Languedoc-Roussillon et le vairon basque.