Engraulicypris sardella se nourrit de zooplancton et a pour prédateurs d'autres espèces de poissons dont des Cichlidae (Rhamphochromis longiceps ou d'autres espèces de ce genre, mais aussi Diplotaxodon limnothrissa), des Bagridae (Bagrus meridionalis) ou encore des Cyprinidae du genre Opsaridium. Cette espèce se reproduit tout au long de l'année et sa population varie au gré de la disponibilité en zooplancton. C'est l'une des espèces pélagiques du lac Malawi, au même titre que certains Cichlidae (notamment du genre Haplochromis qui représentent à eux seuls environ 90 % de la biomasse pélagique). Se retrouvent également dans cet étage pélagique des Clariidae (du genre Dinotopterus) et des Mochokidae (Synodontis njassae).
Se nourrit de zooplancton