Spatuloricaria puganensis mesure une vingtaine de centimètres à l'âge adulte. Comme ses congénères, il possède un corps déprimé avec une nageoire caudale transformée en long filament. La surface dorsale est brun clair, la tête est marron orangée. Cinq barres transversales brun foncé sont réparties de manière séquentielle le long des surfaces dorsale et latérale du corps. La première barre est située dans la région prédorsale, la deuxième juste en arrière du bord de la nageoire dorsale, et les barres restantes le long du pédoncule caudal.
Les mâles possèdent une tête plus triangulaire et sont d'ordinaire plus grand à l'âge adulte.
Ce poisson alguivore solitaire réside posé sur le fond, dans les zones de galets et de rochers. Son corps fin dans les nuances de brun lui permettent de se camoufler facilement dans son environnement.
Spatuloricaria puganensis est un poisson ovipare. Il y a peu d'information concernant son mode de reproduction.
Spatuloricaria puganensis est un poisson-chat vivant dans les rivières de Haute et Moyenne Amazonie d'Amérique du Sud. Les localisations type se trouvent au Pérou, au niveau du Rio Yurua et du Rio Marañón. Cette espèce pourrait être présente en Équateur mais des recherches de terrain sont nécessaires pour valider cette information.