Krobia xinguensis a de profonds pédoncules caudaux et des bandes contrastées et une petite tache foncée en avant de chaque côté de la mâchoire inférieure. La base des écailles des flancs est marquée par de courtes bandes verticales rouges ou orange. Il mesure environ 6 centimètres de long et les nageoires dorsales, anales et pelviennes sont légèrement plus courtes chez les femelles.