Abudefduf margariteus mesure entre 12 et 16 cm. Ce poisson est tricolore avec un corps majoritairement bleu, argent et noir. Il possède également des rayures verticales de couleur noir.
Abudefduf margariteus est un poisson vivant en petit groupes qui réside naturellement à proximité du fond. C'est une espèce omnivore à tendance carnivore au tempérament vif. Abudefduf margariteus est un animal territorial qui ne tolère aucune incursion dans sa zone de vie. Particulièrement virulente contre ses voisins territoriaux, cette espèce peut provoquer des combats musclés. Les relations entre congénères sont également mouvementées, chacun cherchant à sécuriser sa zone de vie.
Abudefduf margariteus est un poisson ovipare qui pond sur substrat découvert. Ce poisson protège sa ponte contre les prédateurs alentours.
Abudefduf margariteus est une demoiselle vivant en eau de mer endémique de l'île Maurice et de l'île de la Réunion.